Можно в загрузчике, который после набора кода появляется, выбрать пункт меню настроек, там есть настройки клавиш эмулятора, правда, какой-то странный, даёт выбрать только два направления, A, B и Turbo A\Turbo B. Это создаст файл с конфигурацие клавишь в подпапке NES вроде (нет на руках аппарата...