Ну это уже как вам больше нравиццо.
через старый ФлешТул (который по COM-порту еще работал и через JTAG) шьется TFlashUpdater_2.4.fls, через новый - можно шить и TFlashUpdater_2.4.bin
Остальные файлы уже не помню зачем, давно дело было.
После чего уже можно зашить обычный набор прошивки...