Во время прошивки происходит переразметка памяти и требуется распаковка файловой системы. Если во флешке много битых секторов, то файловая система не распакуется.
Если человеку, у которого рак, сделать операцию, то он умереть может во время ее проведения, а если не делать, то поживет пару месяцев, а может и лет. Вот вы прошивкой примерно такой же эффект получили. Вы прошили умирающую флешку, которую шить уже было нельзя или бесполезно.