Если AUTO Format FAT будете делать родным FlashTool, т.е. Именно той версией, что выложена с прошивкой на аппарат в разделе прошивок на нашем форуме, то сливать full не обязательно, потому что лишнего программа не сотрет. Прошивку можно слить разве что на случай если вы передумаете.
Эта операция сотрет совершенно все пользовательские данные, в том числе серийные номера и калибровки. Их потребуется восстановить для нормальной работы аппарата. Если возится лениво, то можно просто прошить аппарат с опцией backup-download/format-restore и выставленным флажком auto FAT format. Подробнее описано в инструкции. Бэкапит программа только критические данные, все остальное стирает format.